Para el control y bloqueo del gasoducto se cuenta con una serie de válvulas de compuerta de 8” de diámetro separadas entre sí a una distancia promedio de 12 kilómetros. En la actualidad el Gasoducto al Sur se encuentra conectado a una de las salidas del Scrubber instalado en Neivana de Gas en la zona de compresores, en este sitio existe una válvula bola de 4” de diámetro que permite suspender completamente el suministro de gas al gasoducto.
Anualmente PROGASUR S.A. E.S.P establece para el Gasoducto al Sur Neiva – Hobo (Huila) un programa de mantenimiento con el fin de garantizar la integridad del sistema que por ende le permite ofrecer un servicio de transporte confiable y seguro para el usuario.
Además hace parte del comité de ayuda mutua que opera en esta región, integrado por las empresas del sector y las oficinas gubernamentales (Atención de Emergencias, Cruz Roja, Bomberos, Policía, Defensa Civil, entre otras) que permiten prevenir y atender en un momento cualquier emergencia.